Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM12Q9H4Q4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM12Q9H4Q4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms