Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ9H0N0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ9H0N0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms