Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD2Q9BZL6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD2Q9BZL6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms