Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM54Q9BYV2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms