Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHMP4AQ9BY43 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHMP4AQ9BY43 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHMP4AQ9BY43 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms