Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms