Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CARD11Q9BXL7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CARD11Q9BXL7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARD11Q9BXL7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARD11Q9BXL7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARD11Q9BXL7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARD11Q9BXL7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARD11Q9BXL7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARD11Q9BXL7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CARD11Q9BXL7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CARD11Q9BXL7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CARD11Q9BXL7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CARD11Q9BXL7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CARD11Q9BXL7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARD11Q9BXL7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms