Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms