Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
THUMPD2Q9BTF0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms