Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM56Q9BRZ2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM56Q9BRZ2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms