Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN2Q99700 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN2Q99700 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms