Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA3Q99618 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA3Q99618 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA3Q99618 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms