Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5RAP2Q96SN8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms