Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNC2Q96PR1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNC2Q96PR1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNC2Q96PR1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNC2Q96PR1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNC2Q96PR1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNC2Q96PR1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNC2Q96PR1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNC2Q96PR1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms