Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG8Q96MW5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms