Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TPD52L3Q96J77 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TPD52L3Q96J77 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms