Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VSIG2Q96IQ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms