Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDCA7LQ96GN5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms