Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHMP4CQ96CF2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4CQ96CF2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms