Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
GTF3C6Q969F1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C6Q969F1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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