Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP13Q92995 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP13Q92995 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP13Q92995 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP13Q92995 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP13Q92995 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP13Q92995 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP13Q92995 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP13Q92995 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP13Q92995 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP13Q92995 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP13Q92995 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP13Q92995 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP13Q92995 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP13Q92995 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP13Q92995 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP13Q92995 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP13Q92995 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP13Q92995 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP13Q92995 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP13Q92995 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP13Q92995 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP13Q92995 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP13Q92995 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP13Q92995 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP13Q92995 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP13Q92995 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP13Q92995 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP13Q92995 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP13Q92995 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP13Q92995 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP13Q92995 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP13Q92995 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP13Q92995 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP13Q92995 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP13Q92995 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP13Q92995 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP13Q92995 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP13Q92995 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP13Q92995 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP13Q92995 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP13Q92995 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP13Q92995 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP13Q92995 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP13Q92995 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP13Q92995 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP13Q92995 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP13Q92995 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP13Q92995 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP13Q92995 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP13Q92995 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP13Q92995 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP13Q92995 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP13Q92995 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms