Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms