Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NSMCE1Q8WV22 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE1Q8WV22 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms