Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC148Q8NFR7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms