Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM35BQ8NCS4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM35BQ8NCS4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms