Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms