Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC117Q8IWD4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC117Q8IWD4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC117Q8IWD4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms