Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS6Q8IU80 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMPRSS6Q8IU80 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMPRSS6Q8IU80 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms