Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCA5Q86VQ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms