Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc172Q810N9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc172Q810N9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms