Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TBC1D9Q6ZT07 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TBC1D9Q6ZT07 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms