Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC129Q6ZRS4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC129Q6ZRS4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms