Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM72Q6ZMU5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM72Q6ZMU5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms