Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms