Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CASP12Q6UXS9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms