Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRIG3Q6UXM1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRIG3Q6UXM1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms