Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABRAXAS1Q6UWZ7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms