Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFTA2Q6UW10 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms