Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BLOC1S2Q6QNY1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms