Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDF2Q6PJF5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDF2Q6PJF5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms