Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS38

ALKBH2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH2Q6NS38 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALKBH2Q6NS38 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ALKBH2Q6NS38 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALKBH2Q6NS38 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALKBH2Q6NS38 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALKBH2Q6NS38 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms