Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx11Q6AXC6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms