Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgfbr2Q62312 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgfbr2Q62312 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms