Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprrQ62132 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprrQ62132 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprrQ62132 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprrQ62132 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprrQ62132 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprrQ62132 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprrQ62132 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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PtprrQ62132 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtprrQ62132 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprrQ62132 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprrQ62132 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprrQ62132 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprrQ62132 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprrQ62132 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprrQ62132 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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PtprrQ62132 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms