Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SFMBT2Q5VUG0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFMBT2Q5VUG0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms