Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AGAP9Q5VTM2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms