Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CC2D1BQ5T0F9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CC2D1BQ5T0F9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms