Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms