Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN3Q5JUX0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN3Q5JUX0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms