Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNT1Q5JUK3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms